UCSD-USTC
該校與中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)開展有一系列合作項(xiàng)目，包括華南霧霾的物質(zhì)來源和形成機(jī)制、特大地震破裂規(guī)律等，并取得重要進(jìn)展。
UCSD中國創(chuàng)新中心
在廣東省與美國加州建立友好省州關(guān)系即將滿月之際，天河區(qū)與加州大學(xué)圣迭戈分校在天河智慧城合作建設(shè)UCSD中國創(chuàng)新中心，著力打造科技研發(fā)高地、高端人才培訓(xùn)基地和高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)孵化器。
UCSD-NSYSU
該校自21世紀(jì)起與國立中山大學(xué)結(jié)盟，兩校同為校史較短、海洋學(xué)特長、位于風(fēng)景區(qū)又毗鄰港口的公立研究型大學(xué)。中山大學(xué)作為南臺(tái)灣智庫，設(shè)有美國在中國臺(tái)灣唯一的半官方機(jī)構(gòu)“美國中心”，同美國交流密切，雙邊學(xué)術(shù)交流及研究合作已逾10年。“UCSD-NSYSU雙邊學(xué)術(shù)研討會(huì)”由兩校輪流舉辦，涉及智慧城市、氣膠科學(xué)、生醫(yī)科學(xué)、光電材料、海洋科學(xué)及社會(huì)科學(xué)等領(lǐng)域。
2018年，下屬Scripps海洋研究所（Scripps Institution of Oceanography）再與該校及國立海洋生物博物館簽署合作備忘錄，三方共同宣示未來將就海洋生物多樣性、珊瑚與其共生藻的關(guān)系、珊瑚礁物種繁殖與養(yǎng)殖，以及海洋天然物的開發(fā)等四大重點(diǎn)項(xiàng)目進(jìn)行研究，以跨國規(guī)模的學(xué)術(shù)合作聯(lián)手搶救海洋生態(tài)。2019年亦合作“領(lǐng)導(dǎo)力培育計(jì)劃”。
UCSD-SYSU
該校與廣州中山大學(xué)眼科學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合研究干細(xì)胞治療角膜疾病，相關(guān)成果在《自然》雜志發(fā)表。
