1. 1852年—1870年代末
1852年，瑪麗亞主義者（Marianists）創(chuàng)建了圣瑪麗學(xué)校（St. Mary’s Institute），將天主教教育引入得克薩斯州圣安東尼奧市。圣瑪麗大學(xué)，作為這一瑪麗亞兄弟的教育事業(yè)的傳承，一直致力于實現(xiàn)瑪麗亞主義者倡行的學(xué)術(shù)鉆研、奉獻精神以及服務(wù)社會的理念。
創(chuàng)立圣瑪麗學(xué)校的瑪麗亞主義者，是名為瑪麗亞社團的成員�，旣悂喩鐖F于1817年成立，創(chuàng)始人法國牧師William Joseph Chaminade致力于在后法國大革命時代培育建立世俗和宗教一體社會的觀念以恢復(fù)天主教信仰。四名法國傳教士應(yīng)得克薩斯州加爾維斯頓市（Galveston）主教John MaryOdin之請來得州開辦一所學(xué)校。1852年5月，這些瑪麗亞兄弟們從驛馬車上下來看見了圣安東尼奧市中心—這個他們將在此建立學(xué)校的地方。
1852年8月25日，圣瑪麗學(xué)校成立，第一任校長是Andrew Edel。學(xué)校共有5名教職人員，12名學(xué)生。在Edel的領(lǐng)導(dǎo)下，一年不到學(xué)生增至100多名。1866年，由于瑪麗亞社團人手缺乏，他們開始考慮關(guān)閉學(xué)校。在Edel的堅持下，瑪麗亞社團美國分會的首腦John N. Reinbolt牧師到圣安東尼奧評估這一教育事業(yè)是否還要繼續(xù)。Reinbolt向位于巴黎的總部報告說，將此教育事業(yè)撤出圣安東尼奧“將是一場犯罪”。
1866年后期，Charles Francis接任為第二任校長，學(xué)生增至350多名。學(xué)校建筑持續(xù)增多，1877年，一座四層的“摩天大樓”建立，成為圣安東尼奧當時的最高建筑。
2. 1880年代—1929年大蕭條前
1882年，圣瑪麗學(xué)校更名為圣路易學(xué)院（St. Louis College）。由于圣安東尼奧市中心日益擁擠，1891年，瑪麗亞主義者從West End Town公司購買了位于城市西北部的75英畝土地。該公司同意以1美元的價格將土地賣給學(xué)校，只有一個條件—學(xué)校在一年內(nèi)開工建設(shè)。1894年，新學(xué)校開張，經(jīng)常被稱為伍德勞恩校區(qū)（Woodlawn Campus）。當?shù)匾患覉蠹埛Q圣路易學(xué)院為“一所高貴的學(xué)校，注定成為偉大的西南地區(qū)教育中心”。
此后10年間，學(xué)生繼續(xù)增加了150名，學(xué)校加入了完整的大學(xué)課程，開始授予學(xué)士學(xué)位（baccalaureate）。1911年，圣瑪麗前學(xué)生聯(lián)合會（St. Mary’s Ex-Student Association）成立。
1921年，所有的大學(xué)班級都由市中心校區(qū)遷至圣路易學(xué)院。1923年學(xué)校更名為圣瑪麗學(xué)院（St. Mary’s College）。學(xué)校變化迅速，藝術(shù)和科學(xué)學(xué)院以及商業(yè)管理學(xué)院成立。學(xué)校被得克薩斯州大學(xué)聯(lián)合會（Association of Texas Colleges）承認，并被列為一所高等（senior）大學(xué)。市中心校區(qū)的夜間和暑期項目開始接收女性。1925年，橄欖球校隊成立。
1927年，學(xué)校更名為圣瑪麗大學(xué)（St. Mary’s University）。同年，學(xué)校授予了第一批四年制學(xué)士學(xué)位（bachelor）。
3.大蕭條時期—第二次世界大戰(zhàn)后
大蕭條（TheGreat Depression）使美國的發(fā)展陷入停滯，但是圣瑪麗大學(xué)的入學(xué)人數(shù)持續(xù)增加。1932年，入學(xué)人數(shù)達到500名。1934年，位于市中心的圣安東尼奧法學(xué)院（San Antoniolaw School）并入圣瑪麗大學(xué)，1935年，圣瑪麗大學(xué)法學(xué)院授予了它的第一批法律學(xué)位。1936年，學(xué)校增加了研究生院。
1941年美國加入第二次世界大戰(zhàn)，隨著參軍人數(shù)的增加，入學(xué)人數(shù)減少。通過瑪麗亞主義者的努力，學(xué)校提供與戰(zhàn)爭有關(guān)的項目，得以在有限的經(jīng)費下繼續(xù)運轉(zhuǎn)。到戰(zhàn)爭結(jié)束時，2200名前圣瑪麗學(xué)生參軍，其中70人為保衛(wèi)國家犧牲。
1947年，入學(xué)人數(shù)達到2300名，其中1330名為退伍官兵。1949年，學(xué)校成為大學(xué)及學(xué)校南部聯(lián)合會（Southern Association of Colleges and Schools）的正式會員，法學(xué)院獲得美國法學(xué)院聯(lián)合會（Association of American Law School，簡稱AALS）正式認證。
4. 1950—1980年代
1953年到1961年，牧師Walter Buehler任校長，他將圣瑪麗大學(xué)帶入歷史轉(zhuǎn)折時期，將大學(xué)引上成為現(xiàn)代大學(xué)之路上。在他之前，學(xué)校的人事及大多數(shù)決議都由瑪麗亞社團的分會議事會（Provincial Council）決定。Buehler神父在學(xué)校治理和辦事方面進行了重大變革，他設(shè)立了第一屆治理委員會（Board of Governors），將校長職務(wù)與宗教社團首腦職務(wù)區(qū)分開來，并且設(shè)立了三個副校長職位及行政議事會。
1963年，111年的男校歷史結(jié)束，圣瑪麗大學(xué)正式成為男女同校大學(xué)。大學(xué)包括藝術(shù)與科學(xué)學(xué)校、商業(yè)與管理學(xué)院、法學(xué)院和研究生院，開設(shè)37個專業(yè)。法學(xué)院從市中心遷入伍德勞恩校區(qū)。1960年代末，學(xué)校的入學(xué)人數(shù)接近3000人。
1974年，校友聯(lián)合會（Alumni Association）的烤牡蠣節(jié)（Oyster Bake）成為官方嘉年華節(jié)日，參加人數(shù)持續(xù)增長。1977年，圣瑪麗大學(xué)的125周年，入學(xué)人數(shù)達到3600人，學(xué)生來自42個州，29個國家。
1989年，圣瑪麗大學(xué)成為圣安東尼奧市第一個授予博士學(xué)位（Ph. D.）的大學(xué)。校友Vincent Lin博士及其家族捐贈設(shè)立了“林的偉大演說者系列”（Lin Great Speakers Series）以吸引有創(chuàng)建性的人才。
5. 1990年代—
1990年代和新千年的第一個十年見證了圣瑪麗大學(xué)諸多歷史性活動，很多具有變革意義。1999年，經(jīng)過由明誓的瑪麗亞主義者連續(xù)147年的領(lǐng)導(dǎo)，第一個世俗的校長被任命。
進入新千年，學(xué)校的入學(xué)人數(shù)超過4000人，學(xué)校的學(xué)術(shù)水平穩(wěn)居前列。AT&T信息技術(shù)中心以及教育和家庭生活咨詢中心成立，學(xué)生得以在后者中磨練咨詢能力。
2005年12月，Bill Greehey，圣瑪麗大學(xué)商學(xué)院1960屆畢業(yè)生，一位長期的捐贈者，向商學(xué)院捐贈了2千5百萬美元。這筆捐贈意義重大，商學(xué)院更名為Greehey商學(xué)院。
2010年后，圣瑪麗大學(xué)提供75個學(xué)位和項目，包括Ph.D., J.D.和職前教育。學(xué)校和四大州的大學(xué)簽有交換項目。
圣瑪麗大學(xué)學(xué)生利用更多的時間進行公民服務(wù)，獲得了全國性的認可。圣瑪麗大學(xué)是全美第一個由于致力于服務(wù)、研究及社會階層上升型流動被《華盛頓月刊》（Washington Monthly）雜志提名的大學(xué)，被列入卡內(nèi)基基金會（Carnegie Foundation）的“致力于社區(qū)服務(wù)”名錄下。因在科學(xué)、數(shù)學(xué)和工程督導(dǎo)方面的杰出成就，物理學(xué)教授Richard Cardenas博士被奧巴馬總統(tǒng)授予總統(tǒng)獎—高等教育領(lǐng)域的最高獎項。
2015年3月，學(xué)校獲得“公平貿(mào)易大學(xué)”（Fair Trade University）認證。公平貿(mào)易運動是一個以發(fā)展中國家生產(chǎn)人員的利益為中心，關(guān)注勞工利益、環(huán)保以及社會政策公平性的全球運動。圣瑪麗大學(xué)致力于促進公平貿(mào)易和資源的可持續(xù)利用，并切實在課堂上教授公平貿(mào)易原則，在校園內(nèi)推行公平貿(mào)易產(chǎn)品。
