芝加哥洛約拉大學建于1870年6月30日，初名為圣伊格內(nèi)修斯學院（St. Ingnatius College）。學校原本位于伊利諾伊大學芝加哥分校附近。1908年學校在更名成為芝加哥洛約拉大學。1912年校區(qū)開始轉到今密西根湖畔的校址。

在最早成立的文理學院之外，芝加哥洛約拉大學于1908年成立法學院；1909年成立斯特里奇醫(yī)學院（Stritch School of Medicine）；1922年成立商學院，該商學院今改名為邁克爾·R·昆蘭商學院（Michael R. Quinlan School of Business；1923年成立牙醫(yī)學院（Loyola University School of Dentistry），該學院于1926年合并入芝加哥口腔學院（Chicago College of Dental Surgery）從而擴大了辦學規(guī)模。此后該學院又于1935年合并入洛約拉大學的護理學院（School ofNursing），該學院是第一所在伊利諾伊州被完全認可的護理學校。

洛約拉大學的預科學校早先位于洛約拉大學湖畔校區(qū)歷史最悠久的鄧巴奇禮堂（Dumbach Hall），1957年則遷至維爾美特（Wilmette）。

在1962年，芝加哥洛約拉大學在羅馬建立了約翰·菲利斯文理學院（John Felice Rome Center for Liberal Arts），成為首家在羅馬投資建立學生項目的美國大學。1969年，洛約拉大學成立教育學院（School of Education），同年大學在臨近芝加哥的梅伍德（Maywood）地區(qū)建立了新的醫(yī)學研究中心。1991年，洛約拉大學從圣母瑪利亞修女會（Sisters of Charity of the Blessed Virgin Mary）購下了鄰近的芒德萊恩學院（Mundelein College）。1993年，洛約拉大學關閉了梅伍德校區(qū)的牙醫(yī)學院。

芝加哥洛約拉大學位于芝加哥北端富人區(qū)，是一所歷史悠久的私立名府，但也曾經(jīng)一度出現(xiàn)學校財政方面的問題。 2011年6月11日在超過50000名捐助者的幫助下，學校達到了5億美元的籌資的目標，從而用于今后學校的建設和發(fā)展。該活動共籌得逾5.3億美元，并比預計提前兩年完成。 學校在開展一項名為“Reimagaine”的建設活動，項目由多個工程組成，預計建立多個新的宿舍樓，學生中心，教學樓，并將對原有的設施，場館進行重建，從而不斷改善洛約拉學生的校園生活質量及師資力量。

今日，芝加哥洛約拉大學致力于建成世界一流私立研究型大學。2006年《芝加哥論壇報》（Chicago Tribune）的一篇文章將此舉為“湖岸邊的奇跡”（The miracle along the lake）。