滑鐵盧大學有六個學院，分別為醫(yī)療科學院、文學院、數(shù)學學院、工程學院、理學院、環(huán)境學學院。其他教學單位包括研究生院、藥劑學、眼科視光學和社會工作等研究中心。加拿大最大的環(huán)境學研究學院。學院學校共授予100多種本科學位專業(yè)，28種碩士及博士學位專業(yè)。其中以工程學院和數(shù)學學院最為著名。除開在滑鐵盧市的主校區(qū)外，該校的建筑學學院位于劍橋市的Cambridge校區(qū)，Michael G. DeGroote醫(yī)學院位于Kitchener市，與麥克馬斯特大學共用。
該校作為加拿大重要的高等教育學校，擁有眾多科研機構，包括：
會計研究與教育中心、應用保健研究中心、信息理論中心、分子束與激光化學中心、新牛津英語詞典中心（用計算機編輯）、職業(yè)寫作中心、“社會、技術與價值中心”、圭爾夫/滑鐵盧生物技術中心、遺傳資源中心、計算機研究所、地下水研究所、提高質量與生產率研究所、高分子研究所、風險研究所、多孔介質研究組、第四紀科學研究所、太陽熱工程中心、滑鐵盧納米技術研究所、滑鐵盧人文研究團體、滑鐵盧計算機集成電路制造中心、滑大過程開發(fā)中心、滑鐵盧核磁共振中心，滑鐵盧研究所，滑鐵盧量子及納米計算機研究中心。
